23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0172 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0172  phasin  100 
 
 		 147 aa  289  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  43.85 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  42.55 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  43.18 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  41.67 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  40.87 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  36.03 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  34.4 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  35.61 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  35.65 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  35.88 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  31.62 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  29.84 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  28.57 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  29.46 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  29.46 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  28.57 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  30.21 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  29.25 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  28.3 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  28.3 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  23.14 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  25 
 
 		 127 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>