14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3643 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  100 
 
 		 163 aa  327  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1822  phasin 2  84.71 
 
 		 159 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4291  phasin  79.25 
 
 		 167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1658  phasin 2  76.58 
 
 		 169 aa  240  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2863  hypothetical protein  67.1 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00114886  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  22.93 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  26.28 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  24.62 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  26.98 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  27.78 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  25.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  26.19 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  25.6 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  24.82 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>