42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2345 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2345  phasin  100 
 
 		 118 aa  230  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  50.43 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  51.82 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  48.28 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  49.57 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  49.57 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  50.43 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  44.23 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  49.56 
 
 		 210 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  43.48 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  43.24 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  41.74 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  42.61 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  39.32 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  44.95 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  44.04 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  40.52 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  42.34 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  42.2 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  42.2 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  40.71 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  39.82 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  39.22 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  37.62 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  39.25 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  37.27 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  36.63 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  40.57 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  37.96 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  36.36 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  36.75 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  37.27 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  37.61 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  34.55 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  36.45 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  34.48 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  33.63 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  32.71 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>