47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2499 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2223  phasin  100 
 
 		 118 aa  236  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  100 
 
 		 118 aa  236  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  90.52 
 
 		 117 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  63.56 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  46.49 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  44.74 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  45.95 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  46.55 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  41.38 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  38.79 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  42.34 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  42.24 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  45.61 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  42.34 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  43.86 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  43.86 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  39.47 
 
 		 210 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  40.52 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  42.2 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  43.1 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  43.1 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  35.71 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  35.14 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  36.54 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  33.33 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  32.69 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  33.33 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  34.86 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  37.19 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  34.45 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  32.43 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  37.78 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  29.03 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  32.2 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  31.86 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  30.77 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  28.83 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  26.74 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  25.58 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  32.88 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  28.3 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  29.21 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  26.67 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>