24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1669 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  223  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  60.18 
 
 		 113 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  48.62 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  46.73 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  51.46 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  47.57 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  49.51 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  44.86 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  48.48 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  43.14 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  43.69 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  42.42 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  35.42 
 
 		 299 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  34.65 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  34.26 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  37.97 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3522  phasin family protein  32.32 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  30.21 
 
 		 235 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  32.88 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  32.88 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  25.97 
 
 		 127 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  25.97 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>