41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2492 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2492  phasin  100 
 
 		 158 aa  312  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  93.67 
 
 		 158 aa  279  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  93.67 
 
 		 158 aa  279  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  81.41 
 
 		 162 aa  251  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  71.52 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  77.54 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  57.75 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  52.78 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  54.87 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  53.45 
 
 		 116 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  47.5 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  45.9 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  50 
 
 		 116 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  47.37 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  50.43 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  45.61 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  45.61 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  48.28 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  42.86 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  39.05 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  41.38 
 
 		 127 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  45.69 
 
 		 116 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  41.96 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  40.54 
 
 		 126 aa  87.8  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  40.18 
 
 		 127 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  38.74 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  41.49 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  32.5 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  32.8 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  28.8 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  30.4 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  32.77 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  27.78 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  27.27 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  26.56 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  31.87 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  32.97 
 
 		 113 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>