38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1910 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  100 
 
 		 162 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  57.41 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  54.41 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  55.41 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  54.14 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  54.14 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  53.28 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  45.07 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  48.28 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  45.05 
 
 		 117 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  47.75 
 
 		 120 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  42.34 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  42.34 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  43.97 
 
 		 116 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  36.44 
 
 		 128 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  42.11 
 
 		 118 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  43.97 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  34.75 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  40.52 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  44.23 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  34.82 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  35.34 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  40.52 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  30.25 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  33.33 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  40.52 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  33.93 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  43.16 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  29.51 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  31.93 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  27.64 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  33.33 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  31.48 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  26.61 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  24.79 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  28.46 
 
 		 184 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  24.79 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>