47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1251 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  81.75 
 
 		 148 aa  230  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  63.7 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  64.84 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  59.7 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  64.89 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  56.3 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  41.86 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  34.45 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  37.27 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  35.61 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  33.63 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  32.77 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  34.68 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  34.68 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  37.61 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  30.25 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  31.75 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  33.61 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  32.54 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  32.54 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  31.93 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  39.34 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  37.04 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  34.26 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  35.65 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  37.19 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  37.19 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  32.5 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  31.25 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  32.8 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  33.33 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  33.01 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  32 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  32 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  30.4 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  30.56 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  31.48 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  28.45 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  28.16 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  31.96 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  27.27 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  26.19 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  28.18 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  23.85 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2863  hypothetical protein  29.37 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00114886  normal  0.0679863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>