25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0828 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  72.48 
 
 		 148 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  69.13 
 
 		 149 aa  204  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  67.79 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  42.55 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  38.24 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  35.56 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  38.35 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  32.35 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  32.37 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  35.61 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  31.75 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  31.75 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1658  phasin 2  24 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  28.45 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  24.62 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4291  phasin  26.92 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  23.53 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  33 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  23.53 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  24.37 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  30.28 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  22.69 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  22.69 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  26 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>