40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2326 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2326  phasin  100 
 
 		 116 aa  228  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  77.59 
 
 		 116 aa  180  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  72.41 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  78.45 
 
 		 116 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  77.59 
 
 		 116 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  54.7 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  52.59 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  52.59 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  53.51 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  49.14 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  48.28 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  46.55 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  46.55 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  48.08 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  41.23 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  50.86 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  50 
 
 		 158 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  50.86 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  43.14 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  43.97 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  40.71 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  38.6 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  33.63 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  37.72 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  32.48 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  31.13 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  32.11 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  32.11 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  29.25 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  30.91 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  32.43 
 
 		 184 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  28.44 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  28.44 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  26.55 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  27.52 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  23.85 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  25.23 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  25.77 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  27.47 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  26.88 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>