44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3769 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3769  phasin  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  48.55 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  48.51 
 
 		 143 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  48.44 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  45.74 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  46.51 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  41.86 
 
 		 137 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  40.31 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  35.61 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  36.75 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  34.19 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  33.33 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  31.97 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  36.36 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  29.84 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  27.78 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  27.59 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  27.64 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  29.58 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  32.71 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  27.59 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  27.66 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  26.72 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  30.83 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4291  phasin  26.15 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  26.72 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  22.93 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  25.23 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1822  phasin 2  25.4 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  28.21 
 
 		 123 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  31.86 
 
 		 118 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  31.86 
 
 		 118 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  26.17 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  29.57 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  26.36 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  26.4 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  26.56 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  27.56 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  27.56 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  24.3 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1658  phasin 2  20.61 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  30.09 
 
 		 117 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  25.23 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  23.36 
 
 		 116 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>