9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1658 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1658  phasin 2  100 
 
 		 169 aa  338  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4291  phasin  74.39 
 
 		 167 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1822  phasin 2  73.55 
 
 		 159 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  76.58 
 
 		 163 aa  240  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2863  hypothetical protein  62.25 
 
 		 157 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00114886  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  24 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  25 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  20.61 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  20.74 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>