12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4291 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4291  phasin  100 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  79.25 
 
 		 163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1822  phasin 2  78.71 
 
 		 159 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1658  phasin 2  74.39 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2863  hypothetical protein  67.11 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00114886  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  26.15 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  27.86 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  26.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  24.26 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  23.19 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  22.3 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  29.63 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>