40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8196 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  227  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  93.97 
 
 		 116 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  78.45 
 
 		 116 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  77.59 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  74.14 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  53.51 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  44.83 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  44.83 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  49.04 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  46.49 
 
 		 162 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  43.1 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  43.1 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  43.86 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  38.79 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  42.24 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  35.96 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  44.83 
 
 		 158 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  44.83 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  44.83 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  40.52 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  37.72 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  37.72 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  34.51 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  33.93 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  30.56 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  31.19 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  27.83 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  28.32 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  27.88 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  26.92 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  29.66 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  28.21 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  24.55 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  24.04 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  24.56 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  24.04 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  31.86 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  23.36 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  28.87 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  27.84 
 
 		 113 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>