21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0784 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  30.58 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  33.05 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  30.43 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  33.33 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  29.57 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  30.25 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  28.97 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  27.43 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  28.81 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  29.36 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  29.36 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  28.44 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  29.7 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  29.36 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  33.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  28.7 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  26.67 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  26.67 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  34.48 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>