34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5817 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  233  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  44.44 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  44.68 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  43.62 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  42.27 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  41.05 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  41.67 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  41.67 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  40.66 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  33.61 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  31.09 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  39.8 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  32.5 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  36.75 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  31.09 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  37.72 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  36.08 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  30.83 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  34.95 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  37.76 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  43.16 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  35.71 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  35.71 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  37.72 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  33.67 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  29.35 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  36.46 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0493  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.637535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  32.65 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  29.49 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  34.34 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0093  hypothetical protein  28.38 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  27.27 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  31.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>