25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0414 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0414  phasin  100 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  97.32 
 
 		 149 aa  287  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  69.39 
 
 		 148 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  67.79 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  43.18 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  35.29 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  34.11 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  38.06 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  35.2 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  30.88 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  33.33 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  32.54 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  34.19 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  32.71 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  28.42 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  26.74 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  26.74 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  26.36 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  32.65 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  32.26 
 
 		 178 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  33.67 
 
 		 123 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  22.73 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  23.64 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  24.32 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  23.42 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>