24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1570 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  84.55 
 
 		 123 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  69.9 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  62.5 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  47.47 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  42 
 
 		 112 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  47.52 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  43.56 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  42.16 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  39.6 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  39.22 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  39.62 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  39.45 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  38.14 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  34.29 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  35.23 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  31.96 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  37.84 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  31.76 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  30 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  32.65 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  32.65 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  29.79 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  28.04 
 
 		 288 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>