24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1767 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  100 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  86.73 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  67.96 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  64.42 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  42.98 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  43.36 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  43 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  47.52 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  42.57 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  44.55 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  42.45 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  43.69 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  42.17 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  32.99 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  34.29 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  36 
 
 		 299 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  31.33 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2817  phasin  31.3 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  33.67 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  32.65 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  28.87 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0499  phasin  28.97 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>