62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6072 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1163    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  70.35 
 
 		 568 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  31.64 
 
 		 562 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  27.82 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  24.38 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  25.81 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  26.62 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  26.62 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  25.4 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.39 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  25.22 
 
 		 687 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  27.95 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  29.81 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  24.94 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  25.6 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  26.77 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  26.77 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  26.77 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  26.77 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  24.56 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  25.98 
 
 		 506 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  28.97 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  25.98 
 
 		 510 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  25.59 
 
 		 510 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  28.52 
 
 		 530 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  24.18 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  23.77 
 
 		 689 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  27.01 
 
 		 489 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  24.9 
 
 		 515 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  26.61 
 
 		 670 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  20.14 
 
 		 713 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  24.08 
 
 		 688 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  24.18 
 
 		 825 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  25.43 
 
 		 717 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  24.08 
 
 		 646 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  27.01 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  25.96 
 
 		 550 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 787 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  23.73 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  30.68 
 
 		 663 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  32.18 
 
 		 646 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.33 
 
 		 660 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  28.19 
 
 		 678 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  23.45 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  23.73 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.91 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  23.8 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  23.73 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  24.91 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  23.73 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  28.74 
 
 		 654 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2666  phosphoglycerol transferase  23.73 
 
 		 657 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000321801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  23.77 
 
 		 657 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  23.39 
 
 		 645 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.27 
 
 		 793 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0322  sulfatase  23.68 
 
 		 662 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  23.73 
 
 		 657 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  28.74 
 
 		 670 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  23.77 
 
 		 657 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  29.89 
 
 		 662 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.85 
 
 		 730 aa  43.9  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  26.09 
 
 		 625 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>