15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4167 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  100 
 
 
541 aa  1044    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  58.72 
 
 
539 aa  618  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  56.06 
 
 
525 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  48.96 
 
 
508 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  38.86 
 
 
565 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.91 
 
 
660 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  36.04 
 
 
531 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.42 
 
 
784 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.47 
 
 
793 aa  220  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.92 
 
 
787 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  34.45 
 
 
527 aa  194  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  33.11 
 
 
539 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  30.05 
 
 
574 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  28.97 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  25.47 
 
 
568 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>