29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2565 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  81.6 
 
 		 787 aa  1077    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 793 aa  1515    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.1 
 
 		 784 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.05 
 
 		 660 aa  532  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  53.22 
 
 		 565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  34.27 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  37.84 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  36.58 
 
 		 525 aa  231  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  34.33 
 
 		 541 aa  220  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  32.84 
 
 		 531 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  31.79 
 
 		 527 aa  200  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2744  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.17 
 
 		 315 aa  177  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000569265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  35.2 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  33.12 
 
 		 539 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1179  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.66 
 
 		 250 aa  115  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1990  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.94 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288328  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4357  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 		 245 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0766  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.32 
 
 		 258 aa  94.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1679  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.44 
 
 		 251 aa  90.9  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3017  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.98 
 
 		 208 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0290945 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.93 
 
 		 249 aa  83.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 227 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195582  normal  0.0600399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2452  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.51 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0303  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.11 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3738  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 		 259 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  21.07 
 
 		 597 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3515  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.88 
 
 		 274 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0543  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.54 
 
 		 235 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  26.27 
 
 		 569 aa  44.3  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>