13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3668 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  100 
 
 
508 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  48.77 
 
 
541 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  43.93 
 
 
539 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  48.01 
 
 
525 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.65 
 
 
793 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  45.6 
 
 
565 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.33 
 
 
787 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.4 
 
 
660 aa  224  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.88 
 
 
784 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  36.45 
 
 
531 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  35.19 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  32 
 
 
539 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  29.79 
 
 
574 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>