15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4358 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  100 
 
 
525 aa  1011    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  53.83 
 
 
541 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  48.59 
 
 
539 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  47.83 
 
 
508 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  43.56 
 
 
565 aa  269  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 
793 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.25 
 
 
787 aa  239  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  36.52 
 
 
531 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.33 
 
 
660 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.09 
 
 
784 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  38.35 
 
 
527 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  31.58 
 
 
539 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  30.02 
 
 
574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  29.81 
 
 
569 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  27.01 
 
 
568 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>