30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0314 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
784 aa  1502    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.27 
 
 
660 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.13 
 
 
793 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.16 
 
 
787 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  46.22 
 
 
565 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  33.89 
 
 
539 aa  241  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  33.33 
 
 
541 aa  228  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  34.01 
 
 
531 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  36.6 
 
 
525 aa  227  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  43.53 
 
 
508 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  35.67 
 
 
527 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  32.39 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2744  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.97 
 
 
315 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000569265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  30.99 
 
 
539 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1179  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.2 
 
 
250 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0766  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.25 
 
 
258 aa  101  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1679  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.05 
 
 
251 aa  91.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1990  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.51 
 
 
242 aa  87.4  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.9 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195582  normal  0.0600399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3017  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.73 
 
 
208 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0290945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2452  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.57 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.74 
 
 
249 aa  76.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120935  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4357  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0543  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.91 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0303  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.55 
 
 
245 aa  66.6  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3738  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.19 
 
 
259 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.7 
 
 
260 aa  60.8  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.295476  normal  0.801035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1080  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1995  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.57 
 
 
257 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3515  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.45 
 
 
274 aa  44.3  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>