13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2462 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  100 
 
 
574 aa  1101    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.37 
 
 
787 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.92 
 
 
793 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.64 
 
 
784 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  32.79 
 
 
565 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
660 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  28.61 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  28.34 
 
 
527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  31.22 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  26.36 
 
 
539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  29.89 
 
 
539 aa  113  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  31.39 
 
 
508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  30.62 
 
 
541 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>