32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2752 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
787 aa  1510    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  81.51 
 
 
793 aa  1134    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.42 
 
 
784 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.88 
 
 
660 aa  551  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  53.89 
 
 
565 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  37.29 
 
 
525 aa  252  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  33.21 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  36.3 
 
 
541 aa  238  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  38.07 
 
 
508 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  35.39 
 
 
531 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  33.6 
 
 
527 aa  208  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  34.09 
 
 
539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  34.63 
 
 
574 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2744  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.11 
 
 
315 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000569265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1990  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.59 
 
 
242 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1179  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.2 
 
 
250 aa  106  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1679  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.57 
 
 
251 aa  99.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4357  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.56 
 
 
245 aa  96.3  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.94 
 
 
227 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195582  normal  0.0600399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0766  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.68 
 
 
258 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3017  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.43 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0290945 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0303  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.6 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2452  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.67 
 
 
246 aa  73.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3738  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.67 
 
 
259 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0543  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.53 
 
 
235 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  21.53 
 
 
597 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
260 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.295476  normal  0.801035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3515  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.81 
 
 
274 aa  48.1  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0477  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.13 
 
 
205 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.725974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  24.88 
 
 
569 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3778  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.71 
 
 
186 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0241745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>