26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4168 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0303  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.49 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.6 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195582  normal  0.0600399 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4357  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.98 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1679  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.01 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2744  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.74 
 
 		 315 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000569265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0766  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.24 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1179  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.32 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2452  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.18 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.51 
 
 		 787 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.11 
 
 		 660 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.88 
 
 		 784 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 793 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1990  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.24 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3017  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.18 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0290945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3738  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.85 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5799  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  43.42 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2327  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.987779  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2490  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2117  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.96 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5546  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.82 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2954  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.28 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3851  putative CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  34.58 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1080  hypothetical protein  35.46 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.29 
 
 		 260 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.295476  normal  0.801035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3460  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 209 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>