29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1678 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 660 aa  1276    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.41 
 
 		 784 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.24 
 
 		 793 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.07 
 
 		 787 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  49.06 
 
 		 565 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  33.64 
 
 		 539 aa  229  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  37.36 
 
 		 541 aa  229  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  42.32 
 
 		 525 aa  221  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  34.31 
 
 		 531 aa  207  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  36.67 
 
 		 508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  37.14 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  31.96 
 
 		 539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  32.25 
 
 		 574 aa  157  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2744  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.91 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000569265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3017  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.44 
 
 		 208 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0290945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1179  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.62 
 
 		 250 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1990  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.18 
 
 		 242 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0766  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.66 
 
 		 258 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.38 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195582  normal  0.0600399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1679  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.48 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2452  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.18 
 
 		 246 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.36 
 
 		 249 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0303  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.57 
 
 		 245 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3738  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.59 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4357  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.35 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  23.91 
 
 		 568 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0543  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 235 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  23 
 
 		 569 aa  47.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  22.47 
 
 		 597 aa  43.9  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>