29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3246 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  100 
 
 		 568 aa  1160    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  70.35 
 
 		 569 aa  800    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  31.92 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  22.96 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  25.06 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  28.28 
 
 		 527 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  26.85 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  26.85 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  23.9 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  23.04 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.91 
 
 		 660 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  25.2 
 
 		 507 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  23.08 
 
 		 515 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  25.67 
 
 		 687 aa  50.4  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  23.95 
 
 		 825 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  24.49 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  24.49 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  27.01 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  24.49 
 
 		 510 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  24.49 
 
 		 510 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  26.15 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  23.33 
 
 		 496 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  24.08 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  24.08 
 
 		 510 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  24.08 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  23.36 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  22.95 
 
 		 689 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  25.47 
 
 		 541 aa  43.9  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  22.92 
 
 		 549 aa  43.9  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>