64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1147 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  100 
 
 
525 aa  1061    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  54.58 
 
 
509 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  53.43 
 
 
507 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  51.84 
 
 
512 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  54.33 
 
 
527 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  51.75 
 
 
496 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  51.68 
 
 
510 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  51.48 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  51.48 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  51.68 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  51.68 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  51.48 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  51.48 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  36 
 
 
530 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  36 
 
 
530 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  36.33 
 
 
515 aa  290  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  38.57 
 
 
515 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  34.98 
 
 
493 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  35.29 
 
 
489 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  33.79 
 
 
489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  31.17 
 
 
489 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  31.96 
 
 
496 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  29.94 
 
 
530 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  25.56 
 
 
825 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  33.73 
 
 
636 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  25.77 
 
 
671 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  25.97 
 
 
671 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  24.83 
 
 
645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  29.87 
 
 
687 aa  111  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  28.24 
 
 
628 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  27.37 
 
 
715 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  27.73 
 
 
713 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  26.95 
 
 
688 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  27.03 
 
 
689 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  27.03 
 
 
645 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  25.86 
 
 
722 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  26.95 
 
 
646 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  26.56 
 
 
557 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  26.56 
 
 
714 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  26.56 
 
 
722 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  27.59 
 
 
689 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  25.27 
 
 
691 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  28.36 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  26.22 
 
 
801 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  23.59 
 
 
764 aa  72.8  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  23.85 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.46 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  24.82 
 
 
689 aa  66.6  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.11 
 
 
982 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  29.39 
 
 
640 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  24.44 
 
 
628 aa  54.7  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  26.55 
 
 
569 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  23.53 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  25.57 
 
 
593 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.43 
 
 
549 aa  50.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  21.68 
 
 
595 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  22.88 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  22.88 
 
 
629 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  22.93 
 
 
553 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25.41 
 
 
593 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  26.15 
 
 
568 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  22.02 
 
 
629 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  22.45 
 
 
609 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3180  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein-like protein  27.32 
 
 
362 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>