90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1035 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  100 
 
 
689 aa  1425    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  57.06 
 
 
691 aa  776    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  39.74 
 
 
764 aa  551  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  41.58 
 
 
801 aa  545  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  35.67 
 
 
982 aa  350  6e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  34.48 
 
 
635 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  25.7 
 
 
722 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  27.3 
 
 
689 aa  206  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  26.43 
 
 
714 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  26.12 
 
 
722 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  24.14 
 
 
646 aa  198  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  24.29 
 
 
645 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  26.4 
 
 
557 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  24.37 
 
 
688 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  23.85 
 
 
689 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  26.38 
 
 
713 aa  194  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  24.01 
 
 
645 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  24.51 
 
 
636 aa  154  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  24.27 
 
 
825 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  21.85 
 
 
687 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  25.73 
 
 
671 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  22.79 
 
 
671 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  22.48 
 
 
628 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  23.11 
 
 
509 aa  90.9  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  22.79 
 
 
507 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  25 
 
 
715 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  25 
 
 
496 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  25 
 
 
512 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  25.55 
 
 
510 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  25.08 
 
 
506 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  25.08 
 
 
510 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.08 
 
 
506 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.08 
 
 
506 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.08 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.08 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  23.21 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.26 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  24.82 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  24.69 
 
 
530 aa  65.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  23.13 
 
 
496 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  24.59 
 
 
515 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  25.56 
 
 
553 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  26.79 
 
 
597 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  23.81 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  26.33 
 
 
593 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  22.6 
 
 
530 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.6 
 
 
530 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.48 
 
 
549 aa  57.4  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  25 
 
 
657 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  26.56 
 
 
593 aa  55.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2666  phosphoglycerol transferase  29.25 
 
 
657 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000321801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  24.73 
 
 
657 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  24.73 
 
 
657 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  24.73 
 
 
657 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  24.73 
 
 
657 aa  54.7  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  24.73 
 
 
657 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  24.73 
 
 
657 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  28.57 
 
 
657 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  28.57 
 
 
657 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1620  sulfatase  27.4 
 
 
698 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  20.63 
 
 
489 aa  52  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  26.27 
 
 
657 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  20.28 
 
 
489 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  24.66 
 
 
630 aa  50.8  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1839  sulfatase  24.56 
 
 
709 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  24.5 
 
 
651 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.62 
 
 
730 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  22.42 
 
 
653 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.38 
 
 
727 aa  48.5  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  26.12 
 
 
562 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0686  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.73 
 
 
680 aa  47.8  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.97304  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.24 
 
 
689 aa  47  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  23.17 
 
 
628 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0742  sulfatase  23.53 
 
 
646 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0759  sulfatase  23.53 
 
 
646 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  20.56 
 
 
629 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.29 
 
 
628 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  20.72 
 
 
493 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.29 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.29 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1577  phosphoglycerol transferase  52.78 
 
 
40 aa  46.6  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  22.6 
 
 
628 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  24.5 
 
 
640 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.86 
 
 
732 aa  44.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>