60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2759 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  97.34 
 
 
489 aa  899    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  83.74 
 
 
493 aa  760    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  100 
 
 
489 aa  960    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  58.72 
 
 
496 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  33.46 
 
 
512 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  36.15 
 
 
509 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  33.27 
 
 
496 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  35.29 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  31.94 
 
 
530 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  32.35 
 
 
507 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.54 
 
 
510 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.54 
 
 
510 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.6 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.6 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  32.6 
 
 
510 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  32.6 
 
 
506 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  32.6 
 
 
510 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  33.94 
 
 
527 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  33.04 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  28.94 
 
 
515 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  31.84 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  28.64 
 
 
530 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.64 
 
 
530 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  26.55 
 
 
825 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  24.83 
 
 
671 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  26.1 
 
 
671 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  24.77 
 
 
688 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  25.46 
 
 
689 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  29.58 
 
 
646 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  28.45 
 
 
713 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  29.53 
 
 
636 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  29.17 
 
 
645 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  29.17 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  25.37 
 
 
722 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  25.37 
 
 
557 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  25.37 
 
 
714 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  23.96 
 
 
715 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  25.56 
 
 
722 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  29.89 
 
 
687 aa  83.6  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  26.92 
 
 
645 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  25.75 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  25.19 
 
 
628 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.55 
 
 
635 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  23.74 
 
 
629 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  26.05 
 
 
628 aa  64.3  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  26.58 
 
 
640 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  23.47 
 
 
691 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  21.99 
 
 
609 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.31 
 
 
982 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  22.46 
 
 
402 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  20.28 
 
 
689 aa  55.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  22.58 
 
 
764 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  23.21 
 
 
801 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  23.46 
 
 
614 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.66 
 
 
549 aa  51.6  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  25 
 
 
569 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  22.59 
 
 
581 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  23.32 
 
 
645 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  23 
 
 
597 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  27.16 
 
 
649 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>