78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0125 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  100 
 
 
715 aa  1462    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  29.48 
 
 
671 aa  294  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  29.58 
 
 
671 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  25.35 
 
 
688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  25.76 
 
 
645 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  26.51 
 
 
646 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  25.38 
 
 
636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  26.96 
 
 
689 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  26.05 
 
 
722 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  33.82 
 
 
713 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  25.85 
 
 
557 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  25.74 
 
 
714 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  31.32 
 
 
722 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  25.46 
 
 
689 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  32.68 
 
 
645 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  29.13 
 
 
496 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  29.13 
 
 
512 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  30.34 
 
 
825 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  29.17 
 
 
507 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  30.69 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  26.84 
 
 
687 aa  117  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  30.5 
 
 
510 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  30.14 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  30.14 
 
 
510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  30.14 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  30.07 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  30.14 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  30.14 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  30.14 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  27.84 
 
 
801 aa  106  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  28.41 
 
 
527 aa  107  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  27.4 
 
 
525 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  25.68 
 
 
489 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  28.38 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  23.38 
 
 
628 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  21.71 
 
 
764 aa  90.9  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.59 
 
 
530 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  26.59 
 
 
530 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  25.72 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  24.41 
 
 
691 aa  87  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  25 
 
 
689 aa  83.2  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  24.3 
 
 
489 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  24.03 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.91 
 
 
635 aa  78.2  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.23 
 
 
982 aa  77.4  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  25.78 
 
 
530 aa  73.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  26.1 
 
 
595 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  26.19 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  22.42 
 
 
496 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  28.28 
 
 
593 aa  64.3  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  27.69 
 
 
593 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  22.42 
 
 
630 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  28.86 
 
 
653 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  27.52 
 
 
651 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  26.34 
 
 
657 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  26.57 
 
 
609 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  28.12 
 
 
657 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  28.12 
 
 
657 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  28.12 
 
 
657 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0864  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.92 
 
 
722 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  28.86 
 
 
657 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  27.92 
 
 
628 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  28.5 
 
 
657 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  28.12 
 
 
657 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  30.67 
 
 
657 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  28.5 
 
 
657 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  28.12 
 
 
657 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.21 
 
 
689 aa  52.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2666  phosphoglycerol transferase  27.6 
 
 
657 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000321801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.97 
 
 
727 aa  50.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1839  sulfatase  26.62 
 
 
709 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1620  sulfatase  26.17 
 
 
698 aa  48.5  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.65 
 
 
730 aa  47.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  22.14 
 
 
640 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  22.15 
 
 
630 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0391  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.16 
 
 
691 aa  45.8  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.53 
 
 
732 aa  45.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  25.17 
 
 
628 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>