65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2464 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  83.33 
 
 
489 aa  775    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  83.94 
 
 
489 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  100 
 
 
493 aa  962    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  57.42 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  35.12 
 
 
512 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  34.78 
 
 
496 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  37.04 
 
 
525 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  34.84 
 
 
509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.48 
 
 
510 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.48 
 
 
510 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.75 
 
 
506 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.75 
 
 
506 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  34.29 
 
 
510 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  34.29 
 
 
510 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  34.56 
 
 
506 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  33.1 
 
 
530 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  32.62 
 
 
507 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  35.63 
 
 
527 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  32.19 
 
 
489 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  29.3 
 
 
515 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  28.84 
 
 
530 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.84 
 
 
530 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  35.6 
 
 
515 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  30.17 
 
 
671 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  30.17 
 
 
671 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  24.35 
 
 
688 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  26.82 
 
 
689 aa  97.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  30.08 
 
 
713 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  23.88 
 
 
646 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  30.74 
 
 
636 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  31.46 
 
 
687 aa  93.2  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  27 
 
 
715 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  28.45 
 
 
825 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  23.89 
 
 
689 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  25.86 
 
 
722 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  23.65 
 
 
645 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  25.75 
 
 
722 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  25.75 
 
 
714 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  25.75 
 
 
557 aa  90.5  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  28.82 
 
 
645 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  23.18 
 
 
801 aa  73.6  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  24.65 
 
 
628 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  26.74 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.74 
 
 
635 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.51 
 
 
982 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  26.75 
 
 
628 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  28.57 
 
 
640 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  19.51 
 
 
764 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  23.19 
 
 
691 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  23.21 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  23.92 
 
 
629 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  20.83 
 
 
609 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  20.14 
 
 
689 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  25.93 
 
 
645 aa  50.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  24.02 
 
 
614 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.86 
 
 
549 aa  48.5  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  27.38 
 
 
649 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  25.81 
 
 
611 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  19.64 
 
 
629 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  22.78 
 
 
581 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  24 
 
 
593 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  24 
 
 
593 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  19.34 
 
 
627 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  21.03 
 
 
597 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  19.62 
 
 
595 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>