63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2536 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  100 
 
 		 489 aa  962    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  83.13 
 
 		 493 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  97.34 
 
 		 489 aa  894    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  58.3 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  32.95 
 
 		 512 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  35.57 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  32.74 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  34.45 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  32.18 
 
 		 530 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  31.42 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.6 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.6 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.6 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  32.6 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  32.6 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  32.6 
 
 		 506 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  32.6 
 
 		 510 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  33.6 
 
 		 527 aa  174  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  30.27 
 
 		 515 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  32.66 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  31.94 
 
 		 515 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  29.47 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.47 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  27.71 
 
 		 671 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  26.91 
 
 		 825 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  27.31 
 
 		 671 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  25.23 
 
 		 688 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  30 
 
 		 646 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  28.87 
 
 		 713 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  29.69 
 
 		 636 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  25.46 
 
 		 689 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  30 
 
 		 689 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  29.58 
 
 		 645 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  25.74 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  25.74 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  25.74 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  25.94 
 
 		 722 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  28.08 
 
 		 645 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  24.83 
 
 		 715 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  29.18 
 
 		 687 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  24.02 
 
 		 628 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  26.49 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  26.82 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.55 
 
 		 635 aa  66.6  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  22.96 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  23.83 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  26.78 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  22.46 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.1 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  20.7 
 
 		 689 aa  57  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  23.3 
 
 		 764 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  21.65 
 
 		 609 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  23.87 
 
 		 614 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  23.57 
 
 		 801 aa  54.3  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  25 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.3 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  24.08 
 
 		 645 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  22.97 
 
 		 649 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0565  sulfatase  21.94 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  21.74 
 
 		 602 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  21.74 
 
 		 602 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  23.4 
 
 		 593 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  18.93 
 
 		 625 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>