53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0234 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  100 
 
 
549 aa  1141    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  32.74 
 
 
553 aa  298  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  24.35 
 
 
562 aa  73.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  23.62 
 
 
671 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  21.12 
 
 
645 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  25.33 
 
 
671 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  20.47 
 
 
628 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  23.11 
 
 
515 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  22.84 
 
 
636 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  25.48 
 
 
510 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  25.48 
 
 
510 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  25.48 
 
 
506 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  23.51 
 
 
689 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.48 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.48 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.48 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  23.86 
 
 
714 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  25.48 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  23.86 
 
 
722 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  23.63 
 
 
687 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  22.22 
 
 
509 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  22.9 
 
 
515 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  24.24 
 
 
557 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  22.83 
 
 
722 aa  60.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.21 
 
 
530 aa  60.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  23.21 
 
 
530 aa  60.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  21.1 
 
 
496 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  23.91 
 
 
507 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  20.15 
 
 
489 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  21.48 
 
 
689 aa  57.8  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  24.56 
 
 
569 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  20.33 
 
 
689 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  22.34 
 
 
801 aa  53.5  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  19.96 
 
 
646 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  24.27 
 
 
825 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  22.79 
 
 
713 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  22.62 
 
 
645 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  21.43 
 
 
525 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  21.79 
 
 
530 aa  50.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  21.43 
 
 
512 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  22.62 
 
 
688 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  21.43 
 
 
496 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  19.68 
 
 
982 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  17.96 
 
 
635 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  21.66 
 
 
489 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  25.98 
 
 
653 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  20.65 
 
 
527 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  25.98 
 
 
597 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  20.97 
 
 
764 aa  45.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  22.92 
 
 
568 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  21.3 
 
 
489 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.78 
 
 
630 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  20.41 
 
 
493 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>