134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1567 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  100 
 
 		 645 aa  1328    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  55.16 
 
 		 636 aa  699    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  32.9 
 
 		 688 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  32.58 
 
 		 646 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  32.79 
 
 		 645 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  32.9 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  32.97 
 
 		 689 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  33.52 
 
 		 713 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  31.38 
 
 		 722 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  30.81 
 
 		 722 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  30.81 
 
 		 714 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  30.92 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  27.5 
 
 		 825 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  26.64 
 
 		 628 aa  170  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  26.19 
 
 		 671 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  27.83 
 
 		 671 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  24.01 
 
 		 689 aa  154  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  25.66 
 
 		 764 aa  150  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  25.17 
 
 		 801 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  27.57 
 
 		 687 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.92 
 
 		 635 aa  144  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  33.33 
 
 		 715 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.76 
 
 		 982 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  26.93 
 
 		 509 aa  133  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  27.46 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  24.2 
 
 		 691 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  30.49 
 
 		 496 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  30.49 
 
 		 512 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  30.19 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  29.87 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.87 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.87 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  29.87 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.87 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.87 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  24.83 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  29.24 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.63 
 
 		 527 aa  107  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  29.17 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  25.5 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  24.54 
 
 		 597 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.27 
 
 		 530 aa  94.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  26.27 
 
 		 530 aa  94.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  28.34 
 
 		 593 aa  90.9  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  27.64 
 
 		 593 aa  90.5  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  27.46 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  29.54 
 
 		 630 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  28.7 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  26.61 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  28.75 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  28.33 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  27.98 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  28.63 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  25.39 
 
 		 612 aa  77  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  26.92 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  28.42 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  25.5 
 
 		 530 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  26.71 
 
 		 629 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  22.67 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.92 
 
 		 689 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  29.59 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  26.41 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2666  phosphoglycerol transferase  28.57 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000321801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  28.57 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  28.57 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  29.08 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  29.08 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  28.57 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  28.57 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  28.57 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  28.57 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  28.08 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.91 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  27.52 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  27.52 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.12 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0686  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.21 
 
 		 680 aa  63.9  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.97304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  27.04 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  27.18 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1620  sulfatase  26.67 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1381  sulfatase  27.45 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0400928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  26.14 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0391  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  21.62 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  21.49 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0652  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.23 
 
 		 744 aa  56.6  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0152638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  24.8 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  24.8 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  24.8 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.48 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1839  sulfatase  25.93 
 
 		 709 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  24.8 
 
 		 639 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  24.8 
 
 		 639 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  25.63 
 
 		 642 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  25.63 
 
 		 642 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  24.62 
 
 		 642 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0742  sulfatase  23.29 
 
 		 646 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0759  sulfatase  23.29 
 
 		 646 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  28 
 
 		 639 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  25.13 
 
 		 642 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  25.13 
 
 		 642 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>