131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1807 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1351    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  96.42 
 
 
671 aa  1314    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  29.38 
 
 
715 aa  297  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  27.83 
 
 
688 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  26.68 
 
 
645 aa  184  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  27.83 
 
 
689 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  27.31 
 
 
646 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  27.44 
 
 
689 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  25.21 
 
 
722 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  34.72 
 
 
713 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  27.91 
 
 
714 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  27.91 
 
 
722 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  27.74 
 
 
557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  25.49 
 
 
636 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  27.83 
 
 
645 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  27.05 
 
 
825 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  28.16 
 
 
496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  28.16 
 
 
512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  24.61 
 
 
764 aa  137  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  26.1 
 
 
687 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  26.9 
 
 
628 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  29.58 
 
 
509 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  25.77 
 
 
525 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  29.04 
 
 
507 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.29 
 
 
530 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  31.29 
 
 
530 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.4 
 
 
635 aa  124  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  26.28 
 
 
527 aa  124  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  22.35 
 
 
801 aa  123  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  30.36 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  23.58 
 
 
689 aa  117  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  27.65 
 
 
510 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  27.65 
 
 
506 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  27.65 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.65 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.65 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.65 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.65 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  26.36 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  22.73 
 
 
691 aa  107  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  27.21 
 
 
515 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  30.25 
 
 
493 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  26.01 
 
 
597 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  27.35 
 
 
489 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  27.94 
 
 
496 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  26.12 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.38 
 
 
982 aa  79.7  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  27.43 
 
 
640 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  27.19 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  24.56 
 
 
595 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  26.21 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  25.33 
 
 
549 aa  69.3  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.55 
 
 
629 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  26.64 
 
 
651 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  20.94 
 
 
562 aa  65.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1839  sulfatase  23.24 
 
 
709 aa  64.7  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0864  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.09 
 
 
722 aa  63.9  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  26.3 
 
 
639 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0043  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.95 
 
 
732 aa  61.6  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  26.04 
 
 
639 aa  61.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  26.04 
 
 
639 aa  61.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  26.04 
 
 
639 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  24.13 
 
 
628 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  26.28 
 
 
593 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  24.47 
 
 
642 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  26.74 
 
 
653 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  23.14 
 
 
593 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  24.08 
 
 
627 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  27.76 
 
 
642 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  27.76 
 
 
642 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  24.09 
 
 
639 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  28.05 
 
 
639 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.27 
 
 
730 aa  57  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1586  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  29.14 
 
 
689 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0888013  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  24.87 
 
 
639 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  23.88 
 
 
609 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1620  sulfatase  27.74 
 
 
698 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  27.35 
 
 
642 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  26.94 
 
 
642 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2666  phosphoglycerol transferase  26.91 
 
 
657 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000321801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  26.94 
 
 
642 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  26.94 
 
 
642 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  25.93 
 
 
657 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  27.35 
 
 
642 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  26.94 
 
 
642 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  24.67 
 
 
625 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  26.94 
 
 
642 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  24.87 
 
 
639 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  25.83 
 
 
630 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  25.85 
 
 
657 aa  55.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  27.94 
 
 
639 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  23.39 
 
 
629 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  25.94 
 
 
657 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  24.12 
 
 
642 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  25.39 
 
 
639 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  25.93 
 
 
657 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  25.93 
 
 
657 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  25.93 
 
 
657 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  25.93 
 
 
657 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  25.32 
 
 
402 aa  53.9  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>