90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3915 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  100 
 
 
515 aa  1030    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  45.03 
 
 
515 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  38.73 
 
 
530 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  38.73 
 
 
530 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  38.11 
 
 
509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  39.16 
 
 
512 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  39.79 
 
 
496 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  38.57 
 
 
525 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  38.37 
 
 
507 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  37.9 
 
 
510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  37.57 
 
 
506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  37.57 
 
 
510 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  37.38 
 
 
506 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  37.38 
 
 
506 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  37.5 
 
 
510 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  37.5 
 
 
510 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  39.02 
 
 
527 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  32.24 
 
 
489 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  31.83 
 
 
493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  31.24 
 
 
489 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  31.07 
 
 
489 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  32.27 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  31.85 
 
 
825 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  26.6 
 
 
530 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  30.9 
 
 
636 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  26.28 
 
 
671 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  24.27 
 
 
671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  31.55 
 
 
687 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  29.24 
 
 
645 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  25.23 
 
 
722 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  24.4 
 
 
714 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  25 
 
 
557 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  23.44 
 
 
722 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  26.07 
 
 
628 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  32.27 
 
 
689 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  29.63 
 
 
646 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  31.56 
 
 
688 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  28.01 
 
 
715 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  30.77 
 
 
645 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  28.52 
 
 
713 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  30.77 
 
 
689 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  23.92 
 
 
691 aa  71.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  25.12 
 
 
609 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  25.95 
 
 
562 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  23.11 
 
 
549 aa  65.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  22.22 
 
 
612 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  24.59 
 
 
689 aa  64.7  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  23.37 
 
 
597 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  27.67 
 
 
629 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  24.27 
 
 
553 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  28.09 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  24.65 
 
 
593 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  26.88 
 
 
627 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  26.54 
 
 
593 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  24.03 
 
 
595 aa  60.1  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.55 
 
 
635 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  23.83 
 
 
628 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.3 
 
 
982 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  24.4 
 
 
630 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  22.73 
 
 
764 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  22.3 
 
 
801 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25 
 
 
629 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  24.05 
 
 
625 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  25.81 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  23.08 
 
 
568 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1259  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  34.31 
 
 
730 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000749424  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  29.22 
 
 
640 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0742  sulfatase  29.81 
 
 
646 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  25 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  23.53 
 
 
614 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0759  sulfatase  29.81 
 
 
646 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  25 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0187  membrane protein  32.69 
 
 
659 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0157  membrane associated sulfatase  32.69 
 
 
659 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0182  sulfatase  22.86 
 
 
653 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  24.71 
 
 
657 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0379  sulfatase family protein  25.15 
 
 
646 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0686  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  23.26 
 
 
680 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.97304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2951  sulfatase  24.12 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000274078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  24.12 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  23.03 
 
 
642 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  23.03 
 
 
639 aa  43.9  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  24.2 
 
 
642 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  24.2 
 
 
642 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  24.2 
 
 
642 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  24.2 
 
 
642 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  24.2 
 
 
642 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.45 
 
 
727 aa  43.5  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  26.28 
 
 
649 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  21.12 
 
 
628 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>