105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3016 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  100 
 
 
530 aa  1086    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 
530 aa  1086    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  40.5 
 
 
515 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  39.09 
 
 
515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  36.79 
 
 
525 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  35.67 
 
 
507 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  36.88 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  36.88 
 
 
496 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  37.22 
 
 
509 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  35.35 
 
 
527 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  34.23 
 
 
506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  34.23 
 
 
510 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  34.23 
 
 
510 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.23 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.23 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.23 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  34.23 
 
 
506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  30.89 
 
 
489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  29.07 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  31.29 
 
 
671 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  30.66 
 
 
671 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  28.64 
 
 
489 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  28.64 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  27.17 
 
 
530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  26.37 
 
 
496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  24.36 
 
 
825 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  24.12 
 
 
636 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  30.04 
 
 
687 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  26.27 
 
 
645 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  24.91 
 
 
722 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  25.29 
 
 
722 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  25.29 
 
 
714 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  25.29 
 
 
557 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  26.16 
 
 
646 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  26 
 
 
715 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  25.81 
 
 
645 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  25.81 
 
 
688 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  25.71 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  25.45 
 
 
713 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  25.38 
 
 
689 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  25.86 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  24.72 
 
 
628 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  26.04 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  25.51 
 
 
553 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  21.08 
 
 
689 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.29 
 
 
629 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  26.36 
 
 
562 aa  63.9  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  27.63 
 
 
402 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  26.76 
 
 
597 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  21.83 
 
 
593 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  25.1 
 
 
635 aa  61.6  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  23.21 
 
 
549 aa  60.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  21.83 
 
 
593 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  22.06 
 
 
612 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  26.09 
 
 
640 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  22.67 
 
 
630 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1839  sulfatase  28.48 
 
 
709 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  25.73 
 
 
642 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  26.16 
 
 
629 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  25 
 
 
764 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  25.73 
 
 
642 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  25.73 
 
 
642 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  25.73 
 
 
642 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  25.73 
 
 
642 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  23.92 
 
 
642 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  23.18 
 
 
614 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  25.97 
 
 
627 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  23.08 
 
 
642 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  23.08 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  23.08 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  23.69 
 
 
595 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  23.08 
 
 
642 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0165  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  22.73 
 
 
727 aa  49.3  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  23.08 
 
 
642 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  25.58 
 
 
609 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  22.73 
 
 
639 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  22.73 
 
 
639 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  22.73 
 
 
639 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  22.73 
 
 
639 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0391  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  27.95 
 
 
691 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  22.73 
 
 
639 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  24.91 
 
 
569 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  22.38 
 
 
801 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  22.27 
 
 
639 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1381  sulfatase  23.56 
 
 
714 aa  45.8  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0400928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1066  sulfatase  24.85 
 
 
651 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0686  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  24.03 
 
 
680 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.97304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2012  sulfatase  27.1 
 
 
657 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000485706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  22.27 
 
 
639 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  22.27 
 
 
639 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  21.82 
 
 
639 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  22.27 
 
 
639 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  19.74 
 
 
657 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  19.9 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2737  sulfatase  19.9 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000322483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2688  phosphoglycerol transferase  20.9 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000425258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2947  sulfatase  19.9 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000013293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2993  sulfatase  19.9 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000444572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2289  sulfatase  19.9 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000748062  hitchhiker  1.58706e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2946  sulfatase  19.9 
 
 
657 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1489399999999997e-51 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>