74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0194 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  100 
 
 		 530 aa  1077    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  31.71 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  31.48 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  31.72 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  31.31 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  31.03 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  31.03 
 
 		 496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  29.94 
 
 		 525 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  29.27 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  28.14 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  29.74 
 
 		 510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  29.74 
 
 		 506 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  29.74 
 
 		 510 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.74 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.74 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.74 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  29.74 
 
 		 510 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  26.26 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  27.18 
 
 		 489 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  33.02 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  26.03 
 
 		 515 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.7 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  26.7 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  31.84 
 
 		 713 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  31.64 
 
 		 688 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  31.2 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  30.8 
 
 		 646 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  30.8 
 
 		 689 aa  100  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  27.37 
 
 		 689 aa  92.8  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  27.41 
 
 		 557 aa  90.9  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  26.97 
 
 		 714 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  26.97 
 
 		 722 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  27.94 
 
 		 722 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  28.51 
 
 		 687 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  26.61 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  25.5 
 
 		 645 aa  73.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0125  sulfatase  25.78 
 
 		 715 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0454729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  25.51 
 
 		 671 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  26.21 
 
 		 671 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1397  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.67 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  29.71 
 
 		 636 aa  70.5  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0882  phosphoglycerol transferase-like protein  25.61 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  26.26 
 
 		 628 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  24.69 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1576  phosphoglycerol transferase  26.52 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1565  phosphoglycerol transferase  26.01 
 
 		 801 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0176  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein  26.13 
 
 		 982 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0833847  hitchhiker  0.0000000000178989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  27.41 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  28.04 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3207  sulfatase  23.67 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.803481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  24.62 
 
 		 597 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  28.52 
 
 		 569 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  22.22 
 
 		 553 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  21.54 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  23.44 
 
 		 402 aa  48.9  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  22.43 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  23.55 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  25.1 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.46 
 
 		 629 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  21.91 
 
 		 630 aa  47  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.04 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  23.04 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  21.94 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  22.76 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  22.61 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.04 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  22.12 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.21 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  23.02 
 
 		 627 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>