48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3301 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3301  sulfatase  100 
 
 		 562 aa  1135    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6072  hypothetical protein  31.64 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3246  sulfatase  31.92 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  25.51 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1340  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.17 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  27.68 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  27.68 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2290  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.81 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2167  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.81 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0538  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.81 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1062  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein WcbQ  27.81 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3272  sulfatase  28.09 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3236  sulfatase  28.09 
 
 		 510 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3287  WcbQ  28.09 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  24.74 
 
 		 515 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  28.36 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0769  putative phosphoglycerol transferase  23.9 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3872  sulfatase  25.85 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0234  phosphoglycerol transferase  24.35 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  21.43 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2536  sulfatase  26.49 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2759  sulfatase  26.67 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  20.94 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3915  sulfatase  25.95 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0704  sulfatase  24.32 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0646  sulfatase  26.19 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.69317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2622  sulfatase  26.36 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3016  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.36 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0949  sulfatase  26.82 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.622935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2464  sulfatase  27.62 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0838162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  25.6 
 
 		 689 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  28.03 
 
 		 636 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1805  sulfatase  24.3 
 
 		 687 aa  50.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00015883  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.05 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  22.31 
 
 		 597 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  25.78 
 
 		 713 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0194  sulfatase  25.1 
 
 		 530 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  21.83 
 
 		 722 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  21.46 
 
 		 722 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  21.83 
 
 		 714 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1035  arylsulfatase  26.12 
 
 		 689 aa  47.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  21.83 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  26.92 
 
 		 646 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  26.07 
 
 		 688 aa  47  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  24.91 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1567  sulfatase  24.25 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116076  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  20.39 
 
 		 825 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  24.15 
 
 		 645 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>