39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3180 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3180  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein-like protein  100 
 
 
362 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3254  sulfatase  36.78 
 
 
487 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.233953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  26.88 
 
 
630 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  26.92 
 
 
640 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.41 
 
 
685 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.41 
 
 
685 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  24.15 
 
 
690 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3382  sulfatase  24.54 
 
 
825 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.636616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  25.16 
 
 
712 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  23.65 
 
 
671 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  29.06 
 
 
717 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  27.41 
 
 
685 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.64 
 
 
700 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  26.78 
 
 
640 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  23.89 
 
 
671 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4608  sulfatase  25.61 
 
 
713 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.14 
 
 
700 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4916  phosphoglycerol transferase  24.38 
 
 
645 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  34.69 
 
 
507 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0342  phosphoglycerol transferase  24.38 
 
 
688 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.783488  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  23.28 
 
 
696 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4930  hypothetical protein  25 
 
 
689 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  24.39 
 
 
722 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4898  phosphoglycerol transferase  24.38 
 
 
646 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  26.06 
 
 
695 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  23.27 
 
 
695 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4671  hypothetical protein  24.39 
 
 
557 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1147  sulfatase  29.21 
 
 
525 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0579671  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  20.99 
 
 
712 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4897  putative sulfatase  24.39 
 
 
714 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4531  phosphoglycerol transferase  24.39 
 
 
722 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  25.12 
 
 
597 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0275  sulfatase  26.54 
 
 
636 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  25.5 
 
 
695 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0366  sulfatase  29.33 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00887685  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0781  sulfatase  28.95 
 
 
512 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.610552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  27.1 
 
 
593 aa  42.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0298  sulfatase  28.95 
 
 
496 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  25.79 
 
 
629 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>