44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3254 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3254  sulfatase  100 
 
 		 487 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.233953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3180  phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein-like protein  36.78 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  28.65 
 
 		 640 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1884  sulfatase family protein  24.08 
 
 		 597 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1807  hypothetical protein  27.88 
 
 		 671 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1526  hypothetical protein  27.27 
 
 		 671 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.1 
 
 		 629 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  21.8 
 
 		 627 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  21.72 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3451  sulfatase  22.54 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  22.58 
 
 		 629 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1538  sulfatase  27.88 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  25 
 
 		 593 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  21.31 
 
 		 628 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  26.32 
 
 		 593 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  22.22 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  21.11 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  21.31 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  21.93 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  21.93 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  21.93 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  21.96 
 
 		 630 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  21.93 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  21.93 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  21.93 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4512  phosphoglycerol transferase  27.96 
 
 		 722 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.973658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  23.94 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  24.12 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  23.67 
 
 		 642 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  24.14 
 
 		 642 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  24.32 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  23.67 
 
 		 642 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  23.94 
 
 		 639 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  24.12 
 
 		 639 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  24.86 
 
 		 642 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  23.49 
 
 		 642 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0750  sulfatase  29.63 
 
 		 507 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  23.94 
 
 		 642 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  24.12 
 
 		 639 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>