13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1105 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1105  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1030    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1769  hypothetical protein  37.43 
 
 
531 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0830707  normal  0.577977 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4358  sulfatase  37.7 
 
 
525 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2752  sulfatase  36.59 
 
 
565 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2752  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.62 
 
 
787 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  normal  0.0156376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1678  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.14 
 
 
660 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0660305  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2565  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.16 
 
 
793 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0809744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0314  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.42 
 
 
784 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0304  hypothetical protein  33.82 
 
 
539 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4167  sulfatase  38.73 
 
 
541 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.255365  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3668  sulfatase  40.27 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.902858  normal  0.0745402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2462  sulfatase  30 
 
 
574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0544  sulfatase  29.29 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>