38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05370  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 529 aa  1066    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  53.8 
 
 		 530 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.11 
 
 		 738 aa  80.5  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.48 
 
 		 747 aa  73.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.95 
 
 		 788 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.24 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  22.57 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 766 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  33.93 
 
 		 709 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 804 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 804 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  21.77 
 
 		 715 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  22.08 
 
 		 713 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 477 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.29 
 
 		 496 aa  50.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.47 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  21.75 
 
 		 478 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4029  hypothetical protein  27.63 
 
 		 722 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  25.14 
 
 		 472 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  22.9 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  28.68 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  22.33 
 
 		 662 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.6 
 
 		 756 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  22.44 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  22.25 
 
 		 736 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.25 
 
 		 753 aa  45.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 499 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  21.27 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  20.94 
 
 		 806 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  22.42 
 
 		 772 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  22.09 
 
 		 662 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  29.79 
 
 		 514 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 704 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>