70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4029 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3177  hypothetical protein  83.84 
 
 		 726 aa  1159    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4029  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1420    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.88 
 
 		 733 aa  70.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.97 
 
 		 734 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.35 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.74 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  21.51 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.43 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  24.44 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  20.25 
 
 		 786 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.16 
 
 		 711 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  21.3 
 
 		 753 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.96 
 
 		 743 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  20.62 
 
 		 748 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 624 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  22.34 
 
 		 530 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 279 aa  54.3  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.59 
 
 		 720 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.38 
 
 		 753 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  28.18 
 
 		 246 aa  52.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  20.63 
 
 		 741 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.44 
 
 		 736 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.92 
 
 		 749 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.66 
 
 		 726 aa  51.2  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1844  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis  21.14 
 
 		 773 aa  51.2  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.86 
 
 		 741 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 745 aa  50.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  24.61 
 
 		 496 aa  50.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.53 
 
 		 747 aa  50.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  21.02 
 
 		 802 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.48 
 
 		 789 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  20.53 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 664 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  20.74 
 
 		 721 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.36 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.07 
 
 		 753 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 469 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  20 
 
 		 464 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  27.24 
 
 		 734 aa  48.5  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  24.67 
 
 		 475 aa  48.5  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  21 
 
 		 797 aa  47.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.01 
 
 		 736 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  38.81 
 
 		 472 aa  47.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  23.55 
 
 		 744 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  21.12 
 
 		 662 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  21.21 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  28.18 
 
 		 750 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  21.26 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  24.86 
 
 		 229 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 		 671 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  28.96 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.05 
 
 		 726 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  22.22 
 
 		 249 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1457  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 576 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.2 
 
 		 463 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  23.23 
 
 		 744 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  22.36 
 
 		 746 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  25.08 
 
 		 735 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.32 
 
 		 770 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  41.94 
 
 		 747 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 		 480 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.72 
 
 		 730 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  25 
 
 		 257 aa  44.3  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  38.24 
 
 		 211 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.12 
 
 		 756 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  31.35 
 
 		 229 aa  43.9  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>