More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0427 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
320 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  61.37 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.4 
 
 
302 aa  281  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 
296 aa  272  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.03 
 
 
318 aa  272  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  46.1 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
294 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
297 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
309 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
294 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  39.78 
 
 
287 aa  215  7e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
306 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.25 
 
 
290 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
313 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
290 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.84 
 
 
312 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
296 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
313 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.74 
 
 
308 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
307 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.33 
 
 
327 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
322 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
307 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
287 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
311 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.02 
 
 
313 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  35.76 
 
 
299 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
294 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
300 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
289 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
290 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
295 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.77 
 
 
306 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.67 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.79 
 
 
329 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
292 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.01 
 
 
320 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.56 
 
 
285 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
290 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
311 aa  185  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
335 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
281 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
293 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
306 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
296 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
304 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
289 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  35.69 
 
 
303 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
315 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
305 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
309 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
299 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
321 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
307 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
299 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  30.84 
 
 
318 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
298 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
330 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
284 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
318 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
283 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
293 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
317 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
408 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
314 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
326 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
311 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
286 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
304 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
310 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
301 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.34 
 
 
275 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  29.91 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1006  MalG-type ABC sugar transport system permease component  27.97 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
306 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241092  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
460 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.934772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0927  MalG-type ABC sugar transport systems permease component  32.13 
 
 
335 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0503767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
302 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.19 
 
 
304 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
271 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 
271 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  26.42 
 
 
297 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
283 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>