More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
320 aa  634    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
290 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.65 
 
 
313 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.59 
 
 
327 aa  263  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.5 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 
296 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
311 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
290 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.71 
 
 
290 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
306 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
317 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
315 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
335 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
287 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  46.49 
 
 
299 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
302 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
289 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.25 
 
 
329 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
297 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.66 
 
 
285 aa  222  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  43.14 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.89 
 
 
308 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
294 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
299 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
304 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.76 
 
 
312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
298 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
307 aa  212  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
296 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
292 aa  210  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
293 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
309 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
309 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
322 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
318 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
297 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  35.5 
 
 
318 aa  208  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
303 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
289 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.28 
 
 
306 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
294 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
305 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
306 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  38.87 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
307 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
317 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
295 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
302 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.9 
 
 
315 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
300 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
311 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
301 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
307 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
320 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
304 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
296 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
318 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
310 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  35.23 
 
 
300 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
300 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.9 
 
 
302 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
311 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
326 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
286 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
307 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
300 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
301 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  32.74 
 
 
276 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 
330 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
275 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
277 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
302 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
301 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.72 
 
 
306 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.85 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.64 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
273 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
275 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>